Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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NEDD8Q15843 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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NEDD8Q15843 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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