Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms