Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB2AQ13885 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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TUBB2AQ13885 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TUBB2AQ13885 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TUBB2AQ13885 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TUBB2AQ13885 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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