Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.493e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-16■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 FASTKD1-209ENST00000490590 493 ntTSL 36.56□□□□□ -1.362e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 FASTKD1-208ENST00000488951 541 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 FASTKD1-210ENST00000495505 591 ntTSL 36.08□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.812e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21e-19■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 EIF2A-206ENST00000465535 1273 ntTSL 56.86□□□□□ -1.317e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.285e-44■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RPL19-206ENST00000580333 577 ntTSL 213.8□□□□□ -0.28e-27■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.662e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.412e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-208ENST00000566637 1619 ntTSL 223.28■■□□□ 1.322e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.242e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AGPAT5-204ENST00000523586 468 ntTSL 422.47■■□□□ 1.194e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-204ENST00000564105 1586 ntTSL 1 (best)22.16■■□□□ 1.142e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-209ENST00000567316 452 ntTSL 317.83■□□□□ 0.442e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-203ENST00000562011 324 ntTSL 217.52■□□□□ 0.42e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CTU2-205ENST00000564584 896 ntTSL 316.77■□□□□ 0.282e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PAM16-213ENST00000575942 806 ntTSL 316.53■□□□□ 0.242e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PSMD2-212ENST00000473991 590 ntTSL 315.06■□□□□ 02e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AGPAT5-203ENST00000523234 2525 ntTSL 514.63□□□□□ -0.074e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AGPAT5-202ENST00000518327 852 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.864e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.222e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 TPM4-214ENST00000591645 653 ntTSL 35.33□□□□□ -1.562e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.593e-14■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 GDI1-207ENST00000468483 2417 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.183e-14■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 GDI1-214ENST00000491154 4069 ntTSL 210.85□□□□□ -0.673e-14■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.142e-11■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.692e-11■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AC010132.3-202ENST00000433579 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 228.1■■■□□ 2.096e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PSMA2-201ENST00000223321 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.36e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.86e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PSMA2-203ENST00000436986 1453 ntTSL 39.63□□□□□ -0.876e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 39.2□□□□□ -0.946e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.586e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PRMT1-214ENST00000529836 580 ntTSL 318.76■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT1-206ENST00000526224 578 ntTSL 312.63□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT1-208ENST00000527412 463 ntTSL 39.75□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 DNAJC7-211ENST00000588814 1719 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 CDC20-204ENST00000482046 422 ntTSL 213.18□□□□□ -0.34e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 NUDCD1-203ENST00000519607 2286 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.422e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 COPB2-202ENST00000502734 680 ntTSL 211□□□□□ -0.652e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.772e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.412e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.781e-323■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 518.67■□□□□ 0.581e-323■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.31e-323■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTB-208ENST00000464611 715 ntTSL 59.28□□□□□ -0.921e-323■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.329e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.329e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 GSTP1-206ENST00000495996 221 ntTSL 211.43□□□□□ -0.581e-34■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 RPL24-203ENST00000469605 799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.853e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 518.49■□□□□ 0.554e-12■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 DHRS2-204ENST00000553600 844 ntTSL 216.94■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 UBE2A-201ENST00000346330 718 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-9■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.138e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.428e-8■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 526.42■■□□□ 1.826e-11■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.571e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.312e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.112e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 MED10-202ENST00000503112 925 ntTSL 217.83■□□□□ 0.441e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 227.23■■□□□ 1.955e-22■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.995e-22■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 SMDT1-202ENST00000422252 591 ntTSL 230.94■■■□□ 2.546e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.476e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.263e-33■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.433e-33■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 SERBP1-208ENST00000493607 615 ntTSL 228.13■■■□□ 2.092e-70■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 FAM173A-206ENST00000568916 454 ntTSL 224.83■■□□□ 1.572e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TFR2-204ENST00000462090 1844 ntTSL 520.66■□□□□ 0.94e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TFR2-212ENST00000476304 2421 ntTSL 519.2■□□□□ 0.664e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TFR2-213ENST00000490084 2196 ntTSL 218.89■□□□□ 0.624e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TFR2-206ENST00000465294 2763 ntTSL 214.71□□□□□ -0.054e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.094e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 220.37■□□□□ 0.852e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.842e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 218.24■□□□□ 0.512e-10■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTN1-211ENST00000553882 2636 ntTSL 216.06■□□□□ 0.166e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.456e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTN1-216ENST00000556083 4674 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.496e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.546e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 SF3B6-201ENST00000233468 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.261e-34■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.149e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.644e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 HUWE1-204ENST00000426907 4805 ntTSL 59.98□□□□□ -0.814e-7■■□□□ 13.6
PABPC4Q13310 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.244e-7■■□□□ 13.6
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