Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPRL3Q12980 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms