Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RAB40BQ12829 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RAB40BQ12829 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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