Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1AQ12756 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1AQ12756 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms