Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LOXL1Q08397 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms