Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms