Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms