Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms