Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD1P98174 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD1P98174 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD1P98174 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGD1P98174 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGD1P98174 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms