Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms