Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms