Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKAG1P54619 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms