Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATMP50440 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATMP50440 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATMP50440 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATMP50440 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATMP50440 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATMP50440 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATMP50440 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATMP50440 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms