Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZEB1P37275 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZEB1P37275 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms