Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms