Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms