Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN4P29074 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN4P29074 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms