Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms