Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XBP1P17861 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XBP1P17861 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XBP1P17861 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XBP1P17861 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XBP1P17861 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XBP1P17861 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
XBP1P17861 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XBP1P17861 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XBP1P17861 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XBP1P17861 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
XBP1P17861 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XBP1P17861 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms