Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms