Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGAMP11215 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms