Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF888P0CJ79 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF888P0CJ79 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF888P0CJ79 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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