Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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