Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.93e-11■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.144e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 316.84■□□□□ 0.295e-10■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-9■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 523.01■■□□□ 1.271e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.031e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 519.19■□□□□ 0.661e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 518.78■□□□□ 0.61e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.96■□□□□ 0.471e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 515.95■□□□□ 0.141e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 515.88■□□□□ 0.131e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 415.78■□□□□ 0.121e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.11e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 515.34■□□□□ 0.051e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 515.32■□□□□ 0.041e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 314.85□□□□□ -0.031e-8■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 413.54□□□□□ -0.241e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 513.45□□□□□ -0.261e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 512.55□□□□□ -0.41e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-210ENST00000433417 940 ntTSL 223.24■■□□□ 1.311e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.061e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.851e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-215ENST00000471478 991 ntTSL 519.06■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.631e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-213ENST00000447877 932 ntTSL 518.07■□□□□ 0.481e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-204ENST00000376666 2100 ntTSL 516.45■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-217ENST00000485936 2588 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ENTPD6-216ENST00000481322 414 ntTSL 312.19□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 PCNP-207ENST00000498274 786 ntTSL 217.56■□□□□ 0.44e-17■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PCNP-202ENST00000460231 2165 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.124e-17■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PCNP-204ENST00000469941 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.734e-17■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PCNP-206ENST00000486406 742 ntTSL 27.01□□□□□ -1.294e-17■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.914e-17■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.85e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.685e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ETV4-206ENST00000585508 760 ntTSL 518.26■□□□□ 0.515e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.485e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.345e-7■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 ETV4-210ENST00000590236 616 ntTSL 315.03■□□□□ -05e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.055e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 513.43□□□□□ -0.265e-7■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.46e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.066e-7■■□□□ 11.7
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PRPF4O43172 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.451e-6■■□□□ 11.7
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PRPF4O43172 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.117e-7■■□□□ 11.7
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PRPF4O43172 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.157e-7■■□□□ 11.7
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PRPF4O43172 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.262e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.972e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 AC007780.1-203ENST00000586515 572 ntTSL 510.22□□□□□ -0.771e-15■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 AC007780.1-204ENST00000592030 773 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.811e-15■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 49.24□□□□□ -0.931e-15■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 AC007780.1-202ENST00000591567 549 ntTSL 45.78□□□□□ -1.481e-15■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 LTBP3-204ENST00000525443 3162 ntTSL 215.47■□□□□ 0.074e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 WDR27-206ENST00000474018 951 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PVT1-208ENST00000519481 542 ntTSL 210.4□□□□□ -0.744e-11■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PVT1-209ENST00000520913 584 ntTSL 210.26□□□□□ -0.774e-11■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PVT1-206ENST00000517838 518 ntTSL 27.42□□□□□ -1.224e-11■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-9■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 MCM7-207ENST00000465738 448 ntTSL 28.95□□□□□ -0.982e-9■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 TRIO-204ENST00000502816 736 ntTSL 223.59■■□□□ 1.371e-6■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 TRIO-207ENST00000505971 605 ntTSL 319.35■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PPP1R12A-208ENST00000547330 2275 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.041e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.811e-7■■□□□ 11.7
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