Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms