Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms