Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HHLA1C9JL84 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HHLA1C9JL84 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms