Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms