Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCINQ9Y6U3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCINQ9Y6U3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCINQ9Y6U3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCINQ9Y6U3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCINQ9Y6U3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCINQ9Y6U3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCINQ9Y6U3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms