Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3AQ9Y6K1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms