Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y623

MYH4, Myosin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH4Q9Y623 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH4Q9Y623 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYH4Q9Y623 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH4Q9Y623 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH4Q9Y623 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH4Q9Y623 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH4Q9Y623 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYH4Q9Y623 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYH4Q9Y623 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MYH4Q9Y623 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms