Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF3C3Q9Y5Q9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms