Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM9Q9Y5J7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM9Q9Y5J7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM9Q9Y5J7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms