Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGA8Q9Y5G5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHGA8Q9Y5G5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHGA8Q9Y5G5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms