Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGB5Q9Y5G0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms