Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFG3L2Q9Y4W6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFG3L2Q9Y4W6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms