Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1Q9Y3L3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms