Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC9Q9Y3B6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC9Q9Y3B6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC9Q9Y3B6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms