Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2J1Q9Y385 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms