Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAB39Q9Y376 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAB39Q9Y376 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAB39Q9Y376 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms