Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms