Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BTRCQ9Y297 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms