Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2BQ9Y287 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITM2BQ9Y287 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITM2BQ9Y287 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms