Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SHANK2Q9UPX8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SHANK2Q9UPX8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHANK2Q9UPX8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms