Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCML1Q9UN30 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCML1Q9UN30 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms