Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNRGQ9UMZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNRGQ9UMZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNRGQ9UMZ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.9 ms