Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP17Q9ULZ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP17Q9ULZ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms