Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PALD1Q9ULE6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PALD1Q9ULE6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALD1Q9ULE6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALD1Q9ULE6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALD1Q9ULE6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALD1Q9ULE6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PALD1Q9ULE6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALD1Q9ULE6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALD1Q9ULE6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALD1Q9ULE6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms